무료 피몰(pymol) 대체 프로그램 8개
피몰(pymol) 소개
설명
PyMOL은 3D 분자 구조 렌더링 및 애니메이션을위한 강력하고 포괄적 인 분자 시각화 제품입니다.
공식 홈페이지
플랫폼.
지원사양
chemistry,modeling,proteins,python,sciences,visualization,
무료 피몰(pymol) 대체 프로그램 8개
1. Calistry.org(Calistry.org)
설명
Calistry는 온라인 화학 계산기입니다
날짜까지 Calistry에는 화학 분야의 70 개 이상의 계산기가 포함되어 있습니다
웹 사이트의 모든 내용은 전적으로 무료입니다
계산기 이외에도 Calistry는 선도적 인 분자 동력학 패키지의 좌표 파일을 시각화하는 온라인 분자 뷰어를 제공합니다.
공식 홈페이지
분류
지원사양
calculator,chemistry,molecule-viewer,
2. Rasmol(Rasmol)
설명
RasMol은 단백질 데이터 뱅크 (Protein Data Bank)에서 발견되는 것과 같은 생물학적 거대 분자 구조의 묘사와 탐색을 위해 의도 된 분자 그래픽 시각화 용으로 작성된 컴퓨터 프로그램입니다
그것은 원래 90 년대 초 Roger Sayle에 의해 개발되었습니다
역사적으로 매우 최적화 된 프로그램이 소프트웨어를 겸손하게 강력한 개인용 컴퓨터에서 실행할 수 있기 때문에 분자 생물학 자에게 중요한 도구였습니다
RasMol 이전에는 그래픽 워크 스테이션에서 시각화 소프트웨어가 실행되었습니다
그래픽 워크 스테이션은 비용 때문에 학자들이 쉽게 액세스 할 수 없었습니다
RasMol은 구조 생물학 연구에 중요한 도구가 될뿐만 아니라 중요한 교육 도구가되었습니다 .RasMol에는 복잡한 버전 기록이 있습니다
2.7 버전의 시리즈부터 RasMol은 이중 라이센스 (GPL 또는 사용자 정의 라이센스 RASLIC)에 따라 라이센스가 부여됩니다 .RasMol에는 언어 (특정 단백질 체인 선택 또는 색상 변경 등)가 포함되어 있습니다
Jmol과 Sirius는 RasMol 스크립팅 언어를 명령에 포함 시켰습니다
Protein Databank (PDB) 파일은 Worldwide Protein Data Bank (wwPDB)의 회원으로부터 시각화를 위해 다운로드 할 수 있습니다
이들은 X 선 결정학, NMR 분광학 또는 전자 현미경으로 보통 분자의 구조를 특성화 한 연구자들에 의해 업로드되었습니다 ….
공식 홈페이지
http://www.facebook.com/pages/RasMol/107262322637020
분류
지원사양
chemistry,computational-chemistry,proteins,visualization,
3. Jmol(Jmol)
설명
Jmol은 화학, 생화학 분야의 학생, 교육자 및 연구자를위한 무료 오픈 소스 분자 뷰어입니다
Windows, Mac OS X 및 Linux / Unix 시스템에서 실행되는 크로스 플랫폼입니다
JmolApplet은 웹 페이지에 통합 할 수있는 웹 브라우저 애플릿입니다
Jmol 응용 프로그램은 데스크탑에서 실행되는 독립형 Java 응용 프로그램입니다
JmolViewer는 다른 Java 응용 프로그램에 통합 할 수있는 개발 도구 키트입니다.
공식 홈페이지
분류
지원사양
chemistry,molecular-dynamics,proteins,visualization,
4. 바이오 블렌더(BioBlender)
설명
BioBlender는 오픈 소스 3D 모델링 소프트웨어 인 Blender에 기반한 소프트웨어 패키지입니다
Biology는 나노 스케일에서 작동하며 인간의 눈에는 보이지 않는 물체를 가지고 있습니다
BioBlender를 사용하면 과학 데이터와 3D 조작의 최고 표준을 기반으로 세포를 채우는 캐릭터를 보여줄 수 있습니다
전 세계 과학자들은 원자 수준에서 단백질을 연구하고 공개 저장소 인 단백질 데이터 뱅크 (Protein Data Bank)에 정보를 보관합니다
각 분자는 원자 및 3D 좌표의 목록으로 설명됩니다 …
BioBlender 사용자는 3D 공간에서 단백질을 처리 할 수 있습니다 PDB 파일을 사용자 정의 디렉토리에서로드하거나 PDB 사이트에서 직접 다운로드 할 수 있습니다 (PDB 코드 삽입)
단백질은 3D로 표시되며 (원자 또는 분자 표면으로) 사용자는 표면 특성, 분자 친 화성 (Molecular Lipophilic Potential) 및 정전기 전위 (Electrostatic Potential)를 계산하고 시각화 할 수 있습니다
단백질 모션을 위해 BioBlender는 Blender Game Engine을 사용하여 두 가지 형태 사이의 중간체를 계산합니다
이 프로그램은 중간 PDB 파일과 렌더링 된 이미지를 모두 동영상으로 제공합니다 .BioBlender는 무료 소스, 무료 배포, 멀티 플랫폼, 상호 운용 및 지원되는 3D 애니메이션, 시각 효과 및 비디오 게임 프로그램 인 Blender의 구현입니다
조합 3D 컴퓨터 그래픽, 게임 엔진 및 과학 프로그램 중 하나 인 BioBlender는 단백질 이동을 정교하게하고 텍스처링 및 입자 특수 효과를 기반으로하는 시각 코드를 사용하여 표면 기능을 표시하는 완벽한 도구입니다
이러한 방식으로 분자의 물리적, 화학적 특성을 보여줄 수 있습니다 .BioBlender는 피사 (이탈리아) CNR의 SciVis 그룹과 다른 분야의 과학자 (생물학, 화학 , 물리학, 컴퓨터 과학)
공식 홈페이지
분류
지원사양
bioblender,biolgical-3d-animation,biological-visualization,biology,blender,cell-biology,chemistry,lipophilic-potential,modeling,molecular-dynamics,protein,protein-motion,protein-proteininteraction,protein-visualization,sciences,visualization,
5. QuteMol(QuteMol)
설명
QuteMol은 오픈 소스 (GPL), 양방향, 고품질 분자 시각화 시스템입니다
QuteMol은 OpenGL 쉐이더를 통해 현재 GPU 기능을 활용하여 혁신적인 시각적 효과를 제공합니다
QuteMol 시각화 기술은 대형 분자 또는 복잡한 단백질의 3D 모양 및 구조에 대한 명료성과 이해를 향상시키는 것을 목표로합니다 • 실시간 주변 폐색 • 심도 인식 실루엣 향상 • 공 및 스틱, 공간 채우기 및 감초 시각화 모드 • 고해상도 게시 품질 렌더링을위한 안티 앨리어스 스냅 샷 • 웹 페이지 애니메이션 용 회전 분자의 애니메이션 GIF 자동 생성 • 대형 분자 및 단백질 (> 100k 원자)의 실시간 렌더링 • 표준 PDB 입력 • Win 및 Mac OS X 용 빠른 설치 프로그램 (Intel ) (new!) • 나노 복합 재료 모델링 및 시뮬레이션 프로그램 인 NanoEngineer-1의 플러그인으로 지원 …
공식 홈페이지
http://qutemol.sourceforge.net/
분류
지원사양
6. UCSF 키메라(UCSF Chimera)
설명
UCSF Chimera는 분자 구조 및 관련 데이터의 대화 형 시각화 및 분석을위한 고도로 확장 가능한 프로그램입니다
공식 홈페이지
http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/index.html
분류
지원사양
alignment,dna,protein,rna,structure,
7. RasTop(RasTop)
설명
RasTop은 처음 Roger Sayle에 의해 개발 된 RasMol 프로그램에서 개발 한 분자 시각화 소프트웨어입니다
RasTop은 특히 교육 목적 및 벤치에서 거대 분자의 신속한 분석에 적합합니다
RasTop은 “RasMol 분자 엔진”주위에 사용자에게 친숙한 그래픽 인터페이스를 제공합니다
명령 줄에 입력 할 필요가 없습니다
메뉴의 각 명령은 자체 스크립트를 생성합니다
확장 된 메뉴와 명령 패널을 통해 사용자는 수많은 분자를 빠르게 조작하고 그에 대해 학습 할 수 있습니다
작업 세션은 스크립트 형식으로 저장되며 간단한 마우스 클릭만으로 완전히 다시 생성됩니다 …
RasTop은 Windows 및 Linux 플랫폼에서 사용할 수 있습니다
Linux 사용자는 RasTop 이전에 Wine을 설치해야합니다
Mac 사용자는 Virtual PC를 사용할 수 있지만 자유 소프트웨어는 아닙니다
RasTop은 GPL 라이센스에 의거 한 오픈 소스이며 자유롭게 사용할 수 있습니다
openrasmol.org librar2에서 자세한 정보를 확인하고 다른 사람은 rasmol의 지점을 확인하십시오.
공식 홈페이지
http://www.geneinfinity.org/rastop/
분류
지원사양
crystal,dna,molecule,pdb,protein,rendering,rna,structure,surface,visualization,
8. 우주 공(Space Ball)
설명
우주 공은 아름다운 공간을 연출하는 밝은 게임입니다
놀라운 3 차원 효과, 많은 함정과 장애물은 몇 시간 동안 계속 놀고 있습니다
너는 노는 법을 알고 싶어? 플랫폼에서 플랫폼으로 뛰어 올라서 신비한 장애물을 피할 수 있습니다
세계와 플래시 상황을 변경하면 속도와 반사가 향상됩니다
당신의 두뇌를 사용하고 새로운 전략을 만들어 레벨의 끝으로 가라
그러나 새로운 차원에서 열이 올라갈 것이라는 점을 기억하십시오
그래서 Power Ball을 제어하고 새로운 높이로 뛰어 오릅니다
미래에는 기술을 테스트 할 수있는 새로운 세계를 창조 할 것입니다 ….
공식 홈페이지
https://play.google.com/store/apps/details?id=com.SpaceBal