무료 벡터 NTI(Vector NTI) 대체 프로그램 10개
벡터 NTI(Vector NTI) 소개
설명
벡터 NTI는 생물 정보학 소프트웨어 패키지입니다
현재 버전은 Windows / PC 용 v11.5.1 및 Mac 용 v7.1이지만 Mac OS X v10.3 (Panther) 만 지원합니다
특징은 DNA / 단백질 시퀀스를 생성, 주석 추가, 분석 및 공유하여 BLAST 검색 디자인을 수행하고 저장합니다
PCR, 클로닝, 시퀀싱 또는 하이브 리다이 제이션을위한 프라이머는 클로닝을 계획하고 실 리코에서 여러 단백질 또는 DNA 서열을 정렬하는 젤을 실행합니다
NCBI의 Entrez는 DNA, 단백질 및 표절을보고, 저장하고, 크로마토 그램 데이터를 편집하고, 콘티그로 어셈블합니다
또한 Bioinformatics Vector ), 벡터 DNA, 클로닝 벡터, 발현 벡터 제한 맵 전산 생물학 오픈 소스 생물 정보학 소프트웨어 목록 …
공식 홈페이지
플랫폼.
지원사양
무료 벡터 NTI(Vector NTI) 대체 프로그램 10개
1. Rasmol(Rasmol)
설명
RasMol은 단백질 데이터 뱅크 (Protein Data Bank)에서 발견되는 것과 같은 생물학적 거대 분자 구조의 묘사와 탐색을 위해 의도 된 분자 그래픽 시각화 용으로 작성된 컴퓨터 프로그램입니다
그것은 원래 90 년대 초 Roger Sayle에 의해 개발되었습니다
역사적으로 매우 최적화 된 프로그램이 소프트웨어를 겸손하게 강력한 개인용 컴퓨터에서 실행할 수 있기 때문에 분자 생물학 자에게 중요한 도구였습니다
RasMol 이전에는 그래픽 워크 스테이션에서 시각화 소프트웨어가 실행되었습니다
그래픽 워크 스테이션은 비용 때문에 학자들이 쉽게 액세스 할 수 없었습니다
RasMol은 구조 생물학 연구에 중요한 도구가 될뿐만 아니라 중요한 교육 도구가되었습니다 .RasMol에는 복잡한 버전 기록이 있습니다
2.7 버전의 시리즈부터 RasMol은 이중 라이센스 (GPL 또는 사용자 정의 라이센스 RASLIC)에 따라 라이센스가 부여됩니다 .RasMol에는 언어 (특정 단백질 체인 선택 또는 색상 변경 등)가 포함되어 있습니다
Jmol과 Sirius는 RasMol 스크립팅 언어를 명령에 포함 시켰습니다
Protein Databank (PDB) 파일은 Worldwide Protein Data Bank (wwPDB)의 회원으로부터 시각화를 위해 다운로드 할 수 있습니다
이들은 X 선 결정학, NMR 분광학 또는 전자 현미경으로 보통 분자의 구조를 특성화 한 연구자들에 의해 업로드되었습니다 ….
공식 홈페이지
http://www.facebook.com/pages/RasMol/107262322637020
분류
지원사양
chemistry,computational-chemistry,proteins,visualization,
2. 유진(UGENE)
설명
UGENE은 무료 오픈 소스 크로스 플랫폼 생물 정보학 소프트웨어입니다.
공식 홈페이지
분류
지원사양
bioinformatics,dna,molecular-biology,molecule,ngs,protein,sciences,sequence,sequence-alignment,structure,
3. BioEdit(BioEdit)
설명
BioEdit은 Windows 95 / 98 / NT / 2000 / XP / 7 용으로 작성된 생물학적 서열 정렬 편집기입니다
편리한 기능을 갖춘 직관적 인 다중 문서 인터페이스는 데스크톱 컴퓨터에서 시퀀스의 정렬과 조작을 비교적 쉽게합니다
몇 가지 시퀀스 조작 및 분석 옵션과 외부 분석 프로그램에 대한 링크는 간단한 포인트 앤 클릭 조작으로 시퀀스를보고 조작 할 수있는 작업 환경을 구현합니다
특징 : * 손 정렬의 여러 모드 * ClustalW 자동 정렬 * 자동 폭발 검색 로컬 및 WWW) * Plasmid 도면 및 주석 * 액세서리 응용 구성 * 제한 매핑 * RNA 비교 분석 도구 * 그래픽 매트릭스 데이터보기 도구 * 음영 정렬 그림 * 번역 기반 핵산 정렬 * ABI 추적보기, 편집 및 인쇄 * 사용자 정의 가능한 다른 기능 …
공식 홈페이지
http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit/bioedit.html
분류
지원사양
Discontinued,dna,dna-editor,dna-sequences,plasmid,plasmid-mapping,sequence-alignment,
4. 게놈 컴파일러(Genome Compiler)
설명
게놈 컴파일러는 연구원이 단일 유전자에서부터 전체 게놈에 이르기까지 모든 것을 조작하고 디자인 할 수있게 해주는 사용하기 쉬운 유전자 디자인 플랫폼입니다.
공식 홈페이지
분류
Mac OS X,Windows,Online,Chrome OS,
지원사양
biological-visualization,biology,cad,design,design-tools,design.cad,digest,dna,dna-editor,gene-editor,genetic,genomics,language-translation,molecular-biology,orf,pcr,plasmid,primer-design,primers,primersdn,protein,sciences,synthesis,synthetic-biology,
5. SnapGene 뷰어(SnapGene Viewer)
설명
SnapGene은 펜 및 종이보다 사용하기 쉬운 최초의 분자 생물학 소프트웨어입니다
이제 귀하의 연구실에서 만들어진 모든 DNA 구조를 풍부한 전자 형식으로 문서화 할 수 있으며 무료 SnapGene Viewer 덕분에 전 세계의 동료들과 파일을 공유 할 수 있습니다 .NapGene은 가장 빠르고 쉬운 계획, 시각화 및 문서 작성 방법을 제공합니다 귀하의 분자 생물학 절차
간소화 된 인터페이스는 다양한 복제 및 PCR 조작을 지원합니다
SnapGene Viewer에는 SnapGene의 주요 시각화 도구가 포함되어있어 DNA 맵을 만들고 프라이머를 디자인 할 수 있습니다
주석이 달린 시퀀스 파일은 동료 나 고객과 공유 할 수 있습니다
두 프로그램 모두 많은 공통 파일 형식을 엽니 다.
공식 홈페이지
분류
지원사양
biology,dna,dna-editor,pcr,plasmid,
6. GeneDoc(GeneDoc)
설명
Windows를위한 완벽한 기능의 다중 시퀀스 정렬 편집기, 분석기 및 음영 유틸리티 • 데이터 분석 및 시각화 • 점수 지원 수동 정렬 • 페이지 매김 인쇄물 • Windows 기반 • 고도로 구성 가능 • 내 보낸 수치 • Phylognetic 트리 지원
공식 홈페이지
http://iubio.bio.indiana.edu/soft/molbio/ibmpc/genedoc-readme.html
분류
지원사양
alignment,discontinued,dna,editors,protein,sequencer,
7. Ridom TraceEdi(Ridom TraceEdi)
설명
Ridom TraceEdit는 크로스 플랫폼 그래픽 DNA 추적 뷰어 및 편집기입니다
TraceEdit는 Applied Biosystems 자동화 시퀀서 및 Staden SCF 형식의 파일로부터 얻은 크로마토 그램 파일을 표시합니다
잘못된 기본 호출을 편집하고 저장할 수 있습니다
TraceEdit은 자유롭게 사용할 수 있으며 Windows 및 UNIX 플랫폼에서 작동하도록 설계되었습니다
DNA 시퀀싱은 다른 유형의 DNA 테스트를 비교하는 표준이었습니다
DNA 시퀀싱의 주요 발전으로는 자동화 시퀀서의 개발, 형광 터미네이터 화학의 발견 및 사이클 시퀀싱이 있습니다
이러한 발전으로 인해 시퀀싱 작업이 더 쉬워지고 따라서 널리 사용되었습니다
현재 시퀀싱은 미생물 약제 내성 돌연변이, 암 소질, 체세포 돌연변이 및 유전병을 확인하는 데 사용됩니다
인간 게놈의 시퀀싱과 분자의 새로운 시대로 인해 DNA 시퀀싱의 사용이 증가 할 것으로 기대할 수 있습니다
따라서 기본 전화가 추론 된 크로마토 그램 (흔히 추적 파일이라고 함)을 검사하여 개별 DNA 시퀀스의 증거를 확인해야하는 사람이 늘어나고 있습니다
추적 파일은 ABI 나 SCF와 같은 공용 형식의 독점 형식으로 저장됩니다.
공식 홈페이지
http://www.ridom.de/traceedit/
분류
지원사양
chromatogram,discontinued,dna,sequence,
8. 채도(Chromas)
설명
Technelysium에서 제공하는 두 가지 소프트웨어 응용 프로그램 : Chromas 및 ChromasPro.Chromas는 크로마토 그램 시퀀싱을위한 간단하고 사용하기 쉬운 뷰어 및 편집기입니다
크로마는 다중 시퀀스의 어셈블리가 필요없는 가장 기본적인 시퀀싱 프로젝트에 이상적입니다
편집 된 시퀀스를 내보내거나 식별을 위해 BLAST 서버로 보낼 수 있습니다
크로마는 정렬 기능이 없습니다 .ChromasPro는 서열 판독을 콘티 그램으로 조립하고 제한 효소와 오픈 리딩 프레임 매핑 및 BLAST 검색과 같은 일반적인 서열 분석을위한 것입니다 .ChromasPro는 몇 메가 데이터베이스까지 시퀀싱 프로젝트에 적합하며 기본 시퀀스 편집 및 분석
2Gb RAM이 사용 가능한 경우 최대 100,000 개의 시퀀스가있는 454 및 Illumina 차세대 시퀀서의 데이터를 어셈블 할 수 있습니다
또한 개별 시퀀스 읽기를 편집 할 수 있습니다 ….
공식 홈페이지
http://technelysium.com.au/wp/chromas/
분류
지원사양
Batch processing,batch-processing,dna-editor,dna-sequences,genetic,
9. 시리얼 클로 너(Serial Cloner)
설명
Serial Cloner는 Macintosh 및 Windows 사용자 모두에게 가볍고 강력한 분자 생물학 소프트웨어를 제공하기 위해 개발되었습니다
Linux 버전도 배포됩니다
Serial Cloner는 DNA Strider 호환 파일을 읽고 쓰고 범용 FASTA 형식으로 파일을 가져오고 내 보냅니다
Serial Cloner는 Vector NTI, MacVector, ApE, DNAstar, pDRAW32 및 GenBank 형식으로 저장된 파일을 가져옵니다
VectorNTI 다중 파일 형식에서 가져 오기 기능도 지원됩니다
강력한 그래픽 디스플레이 도구와 간단한 인터페이스는 분석 및 구성 단계를 매우 직관적 인 방식으로 도와줍니다
Serial Cloner 2.5는 시퀀스 및 그래픽 맵에서 Annotations 및 Features를 처리하고 자동으로 시퀀스 기능을 검색합니다.
공식 홈페이지
http://serialbasics.free.fr/Serial_Cloner.html
분류
Mac OS X,Windows,Linux,Discontinued,
지원사양
Discontinued,dna-editor,molecular-biology,
10. ApE – 플라스미드 편집자(ApE – A plasmid Editor)
설명
ApE는 플라스미드 편집을위한 과학 응용 프로그램입니다
편집 창에서 하이라이트 제한 사이트가 효소 사이트의 Dam / Dcm 차단을 미리 반영합니다
사전 정의 된 맞춤 기능 라이브러리를 사용하여 하이라이트 텍스트를 표시합니다
실시간으로 선택한 DNA의 번역, Tm, % GC, ORF를 봅니다
, Fasta, Genbank 및 EMBL files DNA 스트라이더 호환 또는 Genbank 파일 형식으로 파일 저장 Genbank 및 embl 파일의 기능 주석을 사용하여 하이라이트 및 그래픽 맵을 그립니다 NCBI 또는 웜베이스에서 직접 선택한 BLASTs …
공식 홈페이지
http://biologylabs.utah.edu/jorgensen/wayned/ape/
분류
지원사양
biology,dna,dna-editor,dna-sequences,plasmid,